{"id":10157,"date":"2024-09-11T16:48:33","date_gmt":"2024-09-11T16:48:33","guid":{"rendered":"https:\/\/vrid.udec.cl\/?p=10157"},"modified":"2024-09-17T13:25:28","modified_gmt":"2024-09-17T13:25:28","slug":"investigadores-udec-lograron-secuenciar-el-genoma-de-la-araucaria-araucana","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/vrid.udec.cl\/en\/investigadores-udec-lograron-secuenciar-el-genoma-de-la-araucaria-araucana\/","title":{"rendered":"Investigadores UdeC lograron secuenciar el genoma de la Araucaria araucana"},"content":{"rendered":"

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Alianza entre la UdeC y CMPC, con colaboraci\u00f3n de la Universidad de Valencia, obtuvo la primera secuenciaci\u00f3n para una especie del g\u00e9nero y la mayor hecha en Chile, con gran potencial de aplicaci\u00f3n en materia de conservaci\u00f3n.<\/em><\/p>\n

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Sus ancestros convivieron con los dinosaurios y, a trav\u00e9s de los siglos, con su altura y formas ha pintado paisajes \u00fanicos y acompa\u00f1ado a pueblos originarios de nuestras latitudes con su fruto como sustento de la alimentaci\u00f3n y su imagen como representativa de Chile. Aunque la biolog\u00eda de la Araucaria araucana o chilena ha escondido informaci\u00f3n que puede ser vital para fortalecer su vulnerable preservaci\u00f3n y que devel\u00f3 un trabajo local que permitir\u00e1 dar pasos m\u00e1s seguros para resguardar al milenario tesoro natural que se considera un f\u00f3sil viviente.<\/p>\n

Hoy se conoce parte del genoma del \u00e1rbol llamado pehu\u00e9n o pew\u00e9n en mapundung\u00fan y que provee al tradicional pi\u00f1\u00f3n, y se logr\u00f3 descifrar en el proyecto \u201cRescate y Conservaci\u00f3n Araucaria Araucana\u201d, investigaci\u00f3n liderada por el Director del Laboratorio de Epigen\u00e9tica Vegetal de la Facultad de Ciencias Forestales de la Universidad de Concepci\u00f3n (UdeC),\u00a0<\/span>Rodrigo Hasb\u00fan,<\/strong>\u00a0<\/span>en colaboraci\u00f3n con\u00a0<\/span>Tomas Matus<\/strong>\u00a0<\/span>del Instituto de Biolog\u00eda Integrativa de Sistemas de la Universidad de Valencia (Espa\u00f1a), y financiada por CMPC al alero de una estrategia de protecci\u00f3n, restauraci\u00f3n y conservaci\u00f3n de biodiversidad nativa.<\/p>\n

Estudio pionero y de alto impacto cient\u00edfico, ambiental y sociocultural que sus protagonistas presentaron este martes 10 de septiembre en el Vivero Carlos Douglas que posee la empresa en la comuna de Cabrero, donde se albergan ejemplares de la especie de con\u00edfera originaria de los bosques del centro sur chileno y oeste de Argentina, que puede alcanzar 50 metros de altura y mil a\u00f1os de vida que, hoy, est\u00e1 amenazada por una serie de factores ambientales y antr\u00f3picos.<\/p>\n

Al evento asistieron autoridades de la UdeC, CMPC e instituciones p\u00fablicas, y representantes del mundo acad\u00e9mico y forestal regional, quienes se interiorizaron en las implicancias del trabajo en la frontera del conocimiento que supone un hito; el primero de varios que se proyectan.<\/p>\n

El hito<\/strong><\/h4>\n

Y es que es el primer genoma de una especie de Araucaria que se secuencia, el genoma de planta m\u00e1s complejo armado en Chile y se dispuso en una plataforma para su acceso libre por todo usuario, asever\u00f3 Hasb\u00fan, acad\u00e9mico del Departamento de Silvicultura UdeC.<\/p>\n

La alianza para superar el desaf\u00edo de lograr la secuenciaci\u00f3n del genoma del \u00e1rbol nativo milenario parti\u00f3 hace dos a\u00f1os, uniendo esfuerzos entre la academia y la empresa.<\/p>\n

En este contexto, el equipo analiz\u00f3 muestras de la especie y logr\u00f3 una primera versi\u00f3n de genoma disponible en una base de datos p\u00fablica. Y actualmente se trabaja en reensamblar el megagenoma de la Araucaria araucana que se estima de 21 Gb, siempre en miras a seguir avanzando en el ensamblaje hasta llegar a lo m\u00e1s completo posible.<\/p>\n

\u201cUna vez que est\u00e9 terminado en su versi\u00f3n definitiva, el genoma nos va a permitir hacer preguntas sobre la evoluci\u00f3n de la especie, compararlo con especies hermanas y comprender en parte lo que ha pasado en la Tierra: la Araucaria es un f\u00f3sil viviente, ha vivido en la Tierra por mucho tiempo y ese tiempo ha dejado huellas\u201d, explic\u00f3 el acad\u00e9mico.<\/span><\/p>\n

Investigaciones y conocimientos que, luego, se pueden transferir a otras preguntas y materias que, finalmente, pueden \u201cpermitir tener un mejor manejo de la conservaci\u00f3n, m\u00e1s efectiva\u201d, sostuvo la subgerenta de Gen\u00e9tica y Biotecnolog\u00eda de CMPC,\u00a0<\/span>Ver\u00f3nica Emhart,<\/strong>\u00a0<\/span>quien lider\u00f3 el trabajo desde la vereda de la empresa, y la raz\u00f3n es que permitir\u00e1 \u201cdireccionar las estrategias con un asidero cient\u00edfico\u201d, afirm\u00f3.<\/p>\n

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La alianza<\/strong><\/h4>\n

Un proyecto valorado por las autoridades, por sus resultados y por la alianza estrat\u00e9gica que los permiti\u00f3.<\/p>\n

\u201cPara la Universidad es una alegr\u00eda poder ver trabajos conjuntos con el sector privado en torno a temas tan importantes como el estudio del genoma que nos permite analizar cambios y la evoluci\u00f3n de la Araucaria. Y dentro de eso est\u00e1 el impacto que puede tener en la biodiversidad y conservaci\u00f3n de especies que son emblem\u00e1ticas del pa\u00eds\u201d, enfatiz\u00f3 la Vicerrectora de Investigaci\u00f3n y Desarrollo de la UdeC,\u00a0<\/span>Andrea Rodr\u00edguez.\u00a0<\/strong><\/p>\n

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Por su parte el Subgerente de Asuntos Corporativos,\u00a0<\/span>Ignacio Lira,<\/strong>\u00a0<\/span>complement\u00f3 que \u201ccon la UdeC tenemos una larga tradici\u00f3n de colaboraci\u00f3n en varios aspectos, trabajamos en materia de incendios, conservaci\u00f3n de la biodiversidad, en temas de protecci\u00f3n de la naturaleza, y creo que ese es un camino que tenemos que seguir potenciando para el desarrollo del pa\u00eds\u201d.<\/p>\n

Desde all\u00ed, Gustavo N\u00fa\u00f1ez, seremi de Ciencia, Tecnolog\u00eda, Conocimiento e Innovaci\u00f3n para la Macrozona Centro Sur, manifest\u00f3 que \u201ctener un genoma de la Araucaria araucana es un inicio de investigaci\u00f3n enfocada a entender la diversidad gen\u00e9tica de la especie y la adaptaci\u00f3n, y en un escenario bastante importante con una triple crisis (clim\u00e1tica, de biodiversidad y contaminaci\u00f3n), y que es muy relevante entender esto desde el mundo privado y en colaboraci\u00f3n con la academia y lograr generar este tipo de iniciativas\u201d.<\/p>\n

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Hacia la secuenciaci\u00f3n del genoma del pehu\u00e9n: del reto al hito cient\u00edfico<\/strong><\/h4>\n

\u00bfQu\u00e9 es un genoma? \u00bfPor qu\u00e9 es relevante secuenciar? \u00bfC\u00f3mo se puede aplicar el conocimiento? Varias preguntas surgen a ra\u00edz del hito cient\u00edfico local en torno a nuestra Araucaria y sus respuestas son clave para dimensionar el gran potencial de impacto del resultado y los avances que sigan.<\/p>\n

El genoma es la totalidad del material gen\u00e9tico (ADN) de un organismo o especie, y se puede descifrar como c\u00f3digo mediante la tecnolog\u00eda de secuenciaci\u00f3n.<\/p>\n

\u201cHoy la secuenciaci\u00f3n de genoma no es tan compleja. El de una bacteria demora horas y del humano puede tardar d\u00edas. Pero, el de la Araucaria es 8 veces m\u00e1s grande que el humano y no hay otra que tenga un buen genoma (decodificado). Entonces, secuenciar y armar el genoma toma tiempo por lo grande que es, y se requiere mucha capacidad de c\u00f3mputo\u201d, aclar\u00f3 Rodrigo Hasb\u00fan.<\/p>\n

Y el investigador que integra el equipo\u00a0<\/span>Oscar Toro<\/strong>, acad\u00e9mico del Departamento de Bot\u00e1nica de la Facultad de Ciencias Naturales y Oceanogr\u00e1ficas de la UdeC, profundiz\u00f3 que \u201cla Araucaria araucana es representante de las gimnospermas, un grupo bastante ancestral en la clasificaci\u00f3n de plantas y todas se caracterizan por tener un genoma excesivamente grande\u201d.<\/p>\n

En n\u00fameros significa que \u201cel genoma humano son cerca de 3,2 gigas base y en la Araucaria son 25 a 26 millones. Necesitas mucho tiempo de secuenciaci\u00f3n y una fuerte inversi\u00f3n para tener la suficiente cantidad de lectura\u201d, expuso. Por ello que \u201c\u00e9ste podr\u00eda ser el genoma m\u00e1s grande ensamblado en Chile hasta el momento\u201d.<\/p>\n

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Aplicaci\u00f3n e impacto<\/strong><\/h4>\n

Una magnitud que hace juicio al tama\u00f1o del simb\u00f3lico \u00e1rbol milenario. Y as\u00ed de grande es tambi\u00e9n el potencial de impacto de lograr descifrar el genoma y que, de cara al futuro, deber\u00eda saberse aprovechar por actores competentes.<\/p>\n

Lo primordial est\u00e1 en comprender mucho m\u00e1s la evoluci\u00f3n, adaptaci\u00f3n y resiliencia para fortalecer su protecci\u00f3n y preservaci\u00f3n, de una especie cuyo estado de conservaci\u00f3n est\u00e1 clasificado como \u201cen peligro\u201d seg\u00fan la Uni\u00f3n Internacional para la Conservaci\u00f3n de la Naturaleza (IUCN) y el Ministerio de Medio Ambiente. Tala, pastoreo y merma a la cosecha de su semilla, cambio en el uso de suelo incendios forestales y cambio clim\u00e1tico se consideran principales amenazas del gigante de crecimiento extremadamente lento.<\/p>\n

Ante ello es que conocer el genoma puede jugar un rol clave, desde la comprensi\u00f3n de los ancestros hasta la especie moderna.<\/p>\n

\u201cEl linaje de las Araucarias es bastante antiguo, los ancestros directos de la Araucaria araucana estuvieron con los dinosaurios. La Araucaria tiene distribuci\u00f3n gondw\u00e1nica y las especies se encuentran desde Nueva Zelanda, parte de Argentina y Chile y algunas zonas de Brasil, y no hay m\u00e1s. Por eso se conforma como f\u00f3sil viviente, porque tiene la herencia de todos esos linajes que est\u00e1n representados en ese descendiente. Y desde ese punto de vista el genoma puede tener m\u00faltiples aplicaciones\u201d, sostuvo Toro.<\/p>\n

Porque en el genoma van quedando huellas que pueden hablar del pasado e impactar al presente.<\/p>\n

Ejemplific\u00f3 la posibilidad de indagar c\u00f3mo era la vida de la planta en la prehistoria y comparar con el tiempo actual; su exposici\u00f3n y adaptaci\u00f3n y resiliencia ante eventos clim\u00e1ticos extremos como sequ\u00edas y otras presiones ambientales; la vulnerabilidad o resistencia ante pat\u00f3genos u otras amenazas.<\/p>\n

Son algunas posibilidades de investigaciones y conocimientos que se podr\u00edan generar y aplicar en la toma de decisiones y dise\u00f1o de estrategias o pol\u00edticas relacionadas al monitoreo, restauraci\u00f3n y conservaci\u00f3n con m\u00e1s efectividad en un largo plazo.<\/p>\n

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Del presente al futuro<\/strong><\/h4>\n

El estado del genoma es lo que Hasb\u00fan denomin\u00f3 \u201cversi\u00f3n 0.0\u201d, una base desde la que van a avanzar a nuevas etapas hasta llegar a un genoma completo a escala de cromosomas en un futuro cercano.<\/p>\n

\u201cTenemos que terminar de unir los fragmentos. Generamos 10 TB de informaci\u00f3n y para ensamblar el genoma usamos s\u00f3lo 500 MG. Entonces, nos queda un mont\u00f3n de secuencia que podemos usar para mejorar lo que tenemos y pasar a una versi\u00f3n 1.0, donde adem\u00e1s van a estar anotados los genes de Araucaria araucana. Despu\u00e9s viene la versi\u00f3n 2.0, que es tratar de ordenar los fragmentos y llegar a escala de cromosomas, la m\u00e1s visible que tenemos del ADN. En la Araucaria deber\u00edan ser 12 y ya tenemos secuenciado al cloroplasto y mitocondria\u201d, detall\u00f3.<\/p>\n

Y mientras m\u00e1s completa la versi\u00f3n del genoma, m\u00e1s precisa la b\u00fasqueda de respuestas y diversas las investigaciones como las aplicaciones que se posibilitan: \u201cda para d\u00e9cadas de trabajo a partir del genoma\u201d, afirm\u00f3.<\/p>\n

Sobre esta base tambi\u00e9n se espera usar la tecnolog\u00eda y experiencia para abordar otras especies con problemas de conservaci\u00f3n, pudiendo seguir sumando hitos en la ciencia local.<\/p>\n

Hoy existen 22 genomas de referencia de especies de con\u00edferas, s\u00f3lo 1 est\u00e1 completamente ensamblado y 5 a nivel de cromosomas, y ninguno de referencia para una Araucaria.<\/p>\n

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Fuente: Diario Concepci\u00f3n<\/a><\/p>\n

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